Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms