Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SmsP97355 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SmsP97355 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SmsP97355 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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SmsP97355 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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SmsP97355 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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SmsP97355 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SmsP97355 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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SmsP97355 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SmsP97355 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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