Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms