Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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