Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf3P70671 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms