Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad1P70340 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad1P70340 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad1P70340 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad1P70340 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad1P70340 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad1P70340 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad1P70340 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad1P70340 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smad1P70340 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smad1P70340 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smad1P70340 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Smad1P70340 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad1P70340 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms