Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp3P70281 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp3P70281 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms