Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms