Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms