Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crip1P63254 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crip1P63254 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms