Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3eP60229 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3eP60229 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3eP60229 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3eP60229 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3eP60229 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3eP60229 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3eP60229 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3eP60229 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3eP60229 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3eP60229 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3eP60229 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms