Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms