Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms