Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P58686 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P58686 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P58686 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
P58686 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P58686 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P58686 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
P58686 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P58686 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P58686 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms