Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms