Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp1P58466 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms