Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpa1P57784 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpa1P57784 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms