Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms