Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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NcstnP57716 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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NcstnP57716 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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NcstnP57716 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NcstnP57716 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NcstnP57716 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NcstnP57716 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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NcstnP57716 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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NcstnP57716 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NcstnP57716 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NcstnP57716 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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