Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5bP56480 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5bP56480 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5bP56480 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5bP56480 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5bP56480 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5bP56480 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5bP56480 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5bP56480 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms