Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms