Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcanP55066 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcanP55066 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcanP55066 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcanP55066 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcanP55066 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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