Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacnb3P54285 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms