Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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RabggtbP53612 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RabggtbP53612 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RabggtbP53612 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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