Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms