Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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