Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms