Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TspoP50637 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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TspoP50637 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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TspoP50637 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TspoP50637 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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