Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FmodP50608 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FmodP50608 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms