Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CitP49025 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CitP49025 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CitP49025 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CitP49025 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CitP49025 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CitP49025 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CitP49025 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CitP49025 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CitP49025 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CitP49025 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CitP49025 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CitP49025 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CitP49025 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms