Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms