Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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VdrP48281 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VdrP48281 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VdrP48281 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VdrP48281 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VdrP48281 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VdrP48281 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VdrP48281 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VdrP48281 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VdrP48281 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VdrP48281 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VdrP48281 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VdrP48281 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VdrP48281 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VdrP48281 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VdrP48281 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VdrP48281 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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