Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl13P47963 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl13P47963 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl13P47963 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl13P47963 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl13P47963 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl13P47963 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl13P47963 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl13P47963 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl13P47963 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl13P47963 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms