Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx1-2P42580 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms