Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms