Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TtlP38585 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms