Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lig1P37913 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms