Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms