Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfc1P35601 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms