Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms