Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms