Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa2P31245 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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