Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms