Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprmP28828 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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