Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kif5cP28738 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms