Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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