Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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