Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms