Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjc1P28229 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms