Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CebpbP28033 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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